رابط في مكتبة المصفى مدة طويلة للاجتهاد في الطلب وكان يطلب نهارا ويعمل ليلا لينفق على نفسه.
يعد الشيخ الحويني من رموز المدرسة السلفية العلمية والتي تختلف عن السلفية السياسية والسلفية الجهادية.
أثارت بعض آراء الشيخ الحويني جدلاً واسعاً في المجتمع المصري والعربي ومن أبرزها
ودعا البعض تلاميذ الحويني إلى "ألا يتذكروا فتاواه الغريبة ... وأن يتذكروا شجاعة الاعتذار عنده".
وغيرهم كثير من أهل العلم، وهناك من لقيهم الحويني في مصر وغيرها لا سيما في رحلاته في النسك والدعوة.
ويشار إليه كمرجع في علم الحديث النبوي حيث كان متخصصاً في تمييز الأحاديث الصحيحة من الضعيفة
منتدى العلماء يعزي الأمة الإسلامية في وفاة الشيخ العلامة أبو إسحاق الحويني -رحمه الله تعالى-
أسوة بالأغا خان..هل يدفن الشيخ أبي إسحق الحويني في مصر ؟
فيما رأى آخرون أن الحويني "كان يعيش خارج العصر أو فيما يُسمى عصور الظلام ويجعل من الإسلام ديناً ضيقاً جداً والتحريم فيه يفوق الحلال بكثير"، على حدّ تعبيرهم.
دعا check here المصريين للتصويت لصالح مرسي وأيد قراراته كما طالبه بمنع دخول الشيعة إلى مصر
وأحدث هذا الاكتشاف هزة فكرية لديه، أثرت حتى على استماعه لخطب الشيخ كشك، إذ أصبح يشكك في كل حديث يسمعه.
كما قام بتحقيق وشرح عدد من كتب التراث منها البعث لعبد الله بن أبي داود وفضائل فاطمة رضي الله عنها لابن شاهين والأحاديث القدسية الأربعينية لملا علي القاري
يذكر أن الداعية الإسلامي قد احتجب عن الإعلام في الفترة الأخيرة واكتفى بدروسه الدينية التي يعطيه في مسجده في قرية الحويني بمحافظة كفر الشيخ، خاصة مع ضعف صحته حيث أنه يعاني من مرض السكر ومضاعفاته التي أدت إلى قطع إحدى ساقيه في السنوات الأخيرة.
لم يكن لعلوم الشريعة حضور في حياة الشاب الحويني في مراحل دراسته الأساسية في قريته ومدينته قبل الجامعة، ولم يكن هو أو من حوله مهتمين بها، لكن صدفة عابرة كانت كفيلة بتغيير مسار حياته بالكامل.